他们在继续做好为防汛防旱和工程建设管理服务的同时，主动开展水资源、水环境、水生态等监测、分析和评价，为全省水资源统一管理和保护做了大量工作。2007年太湖蓝藻暴发引发无锡市供水危机以来，江苏水文局组织太湖沿线水文职工，对太湖所有水源地、调水引流沿线、环太湖出入口门等重要水域的水量水质，实行每日跟踪监测和巡查，编发水质快报，及时掌握水量、水质和蓝藻的变化趋势，并对太湖湖体和主要水源地实行日巡查制度，为实施太湖湖泛预警和有效处置提供及时准确的信息服务；为掌握苏北六市用水状况，他们连续多年对苏北运河沿线扬州等六个市的34个市际断面进行全年逐日计量监测，为苏北供水价格调整以及各市用水计划的制定和监督考核，提供了宝贵资料和基本依据；为积极推进和实施省政府环境资源区域补偿制度，江苏水文局对太湖流域所有河流县以上行政交界情况进行调查。从2008年1月起，陆续在太湖流域10条河开展环境资源补偿断面的水量(流向)监测。2009年1月起，又增加20处市际交界断面的监测，无锡、常州分局还受所在市政府委托，开展24处县际交界断面的监测。

    江苏水文人坚持以改革统揽全局，以创新促进发展，为水文事业发展注入新的活力。近年来，水文部门先后进行了二次内部人事制度改革，全面推行竞争上岗，实行内部全员岗位聘用，坚决打破大锅饭，建立岗位绩效工资制度，充分调动了职工的生产积极性，有力地推进了水文事业健康、稳步发展；在基层工作方式改革方面，他们根据站网的不同性质、作用和类别，研究不同的测验方法、精度控制、建设标准和管理形式。减少驻测，发展巡测，推广桥测、间校测，扩大委托，普及遥测和长期自记，逐步实现运用遥测数据替代人工观测报汛，运用自动采集数据进行资料整编；今年出台的《江苏省水文条例》，明确了水文部门六项行政许可职能，建立了水文资料使用审查等十项制度，有力的推动了全省水文系统管理体制运行机制改革。2009年1月成立泰州、宿迁水文分局，全省全部按行政区划设立了市级水文机构。同时，积极推进市级水文机构实行以省为主，省市双重领导管理体制改革。无锡、常州、淮安水文分局挂牌成立了市级水文机构、溧阳市挂牌成立了县级水文机构。为适应管县体制改革，以县为单位设立了28个水文水资源监测中心，研究和探索县级水文机构的设置和建设。

    为激发职工的工作热情，培养高度的责任心和使命感，江苏省水文局还在全系统广泛开展爱岗敬业、无私奉献教育活动，开展"文明水文站"、"达标水文站"和文明单位创建活动，涌现出一大批"文明水文站"、"达标水文站"。其中有7个测站被授予全国文明水文站；有23个测站被授予省级文明水文站；有10个分局被评为市级或全省水利系统文明单位；有12个监测中心（科室）被评为省级机关或省级"青年文明号"；先进党支部、优秀党务工作者、共产党员示范岗、优秀党员、优秀团员、优秀青年、知识型学习标兵、五一巾帼标兵岗、巾帼文明示范岗等一系列荣誉称号，水文部门和水文职工均榜上有名。